Nhưng Godzilla cũng khác biệt so với một thảm họa tự nhiên đơn thuần, quả vậy. Godzilla là một quái vật ra đời từ hành động của con người, từ những hoạt động thử hạt nhân. Godzilla là phép ẩn dụ cho thảm họa hạt nhân, hay nói rộng hơn là cơn phẫn nộ của thiên nhiên trước sự can thiệp thô bạo của con người. Godzilla là sự “trừng phạt” của Trái Đất dành cho sự ngạo mạn của loài người. Chính vì thế, Godzilla của Hideaki Anno không có tính cách, không có lòng trắc ẩn, thậm chí có lẽ còn không có nhận thức thật sự. Godzilla tàn phá và hủy diệt theo bản năng – tìm kiếm nguồn “thức ăn”, và chỉ phản ứng lại khi có tác nhân nào đó ảnh hưởng đến nó. Nó không thiện, cũng không ác, bởi nó chưa bao giờ thực sự chủ động tìm diệt con người. Ngay cả khi Godzilla sử dụng hơi thở nguyên tử, cũng là để tự vệ bản thân. Godzilla hành động gần như mù quáng, có lẽ gần như không nhận thức được những sự tàn phá và chết chóc mà nó gây ra. Có lẽ với nó, những thứ ấy chẳng có nghĩa lý gì, bởi vì trước thế lực tự nhiên, đau khổ của con người có là gì?
